A origem do fagote ainda não está totalmente esclarecida, mas acredita-se que o instrumento tenha surgido a partir da dulciana, que possuía um metro de altura e era formada por dois tubos cônicos de madeira conectados na base. Provavelmente a dulciana foi sendo gradativamente modificada até dar origem ao fagote atual. Ao longo dos anos foram adicionadas chaves, as distâncias entre os orifícios e seus tamanhos foram aprimorados, a madeira alterada, a extensão aumentada e a campana e o tudel foram redesenhados. O fagote moderno surgiu após as modificações realizadas por Carl Almenraeder (1786-1846) entre 1817 e 1843. Almenraeder acrescentou algumas chaves, ajustou outras, deslocou e alargou orifícios. Tudo isso feito com o objetivo de melhorar a entonação do fagote, tornar o dedilhado mais simples e o som mais uniforme. Existem dois sistemas de dedilhados e formas de tocar o fagote: o estilo francês, caracterizado pelo instrumento de Buffet, e o alemão, caracterizado pelos instrumentos de Heckel. O instrumento alemão, por possuir sonoridade mais fluente e fácil de controlar, tende a ser mais utilizado do que os instrumentos franceses.
